Основан в 1967 г. Журнал «Микология и фитопатология» публикует оригинальные работы, методические статьи, обзоры и дискуссии, хронику по всем разделам микологии и фитопатологии, включая систематику, экологию, физиологию и генетику грибов, а также биотехнологию и защиту растений. Издание является рецензируемым и входит в Перечень ВАК для опубликования работ соискателей ученых степеней. С 2010 г. журнал индексируется системой РИНЦ, с 2015 г. системой Scopus.