Основан в 1995 г. Публикуются оригинальные статьи по флоре и фауне водных объектов, биологии, морфологии, систематике, экологии гидробионтов, этологии, экологической физиологии и биохимии водных организмов, структуре и функционированию водных экосистем, антропогенным воздействиям на водные организмы и экосистемы, методике гидробиологических исследований. Журнал является рецензируемым и включен в Перечень ВАК для опубликования работ соискателей ученых степеней. С 2008 г. входит в систему РИНЦ.